מטרת התוכנית לתואר שני היא לפתח, להרחיב ולהעמיק את הידע התיאורטי והמקצועי של מרפאים בעיסוק, למטרות מחקר, ניהול, הנהגה והדרכה. כמו כן מכשירה התוכנית אנשי מקצוע למעורבות בקהילה. מסלולי הלימוד נחלקים לשלושה: מחקרי (עם תזה), עיוני (פרויקט ללא תזה) ומסלול ייעודי לשיקום ובריאות הנפש.